タンパク質立体構造予測をWeb上で実行できるものを開発しました
タンパク質立体構造予測をWeb上で実行できるものを開発しました。 名前は、gfufoldです。(予測はESMFoldに準じています)
アミノ酸配列を入力して「START」ボタンを押すだけで、 タンパク質立体構造をWebGLによってぐりぐりさわりながら確認できます。
予測結果は、PDB, CIFのファイル形式で、 また入力の配列データもテキスト(.txt)で保存することができます。
お問い合わせ等は下記メールアドレスまでよろしくお願いいたします。
uuktuv@gmail.com
※ テスト時のアミノ酸配列として、PETaseのアミノ酸配列を入力してみてください。
MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMRGPNPTAASLEASAGPFTVRSFTVSRPSGYGAGTVYYPTNAGGTVGAIAIVPGYTARQSSIKWWGPRLASHGFVVITIDTNSTLDQPSSRSSQQMAALRQVASLNGTSSSPIYGKVDTARMGVMGWSMGGGGSLISAANNPSLKAAAPQAPWDSSTNFSSVTVPTLIFACENDSIAPVNSSALPIYDSMSRNAKQFLEINGGSHSCANSGNSNQALIGKKGVAWMKRFMDNDTRYSTFACENPNSTRVSDFRTANCSLEDPAANKARKEAELAAATAEQ