LIFE LOG(ここにはあなたのブログ名)

作業日誌 う靴

気ままにコンピュータ関連の備忘録などを書きます...。

タンパク質立体構造予測をWeb上で実行できるものを開発しました

タンパク質立体構造予測をWeb上で実行できるものを開発しました。 名前は、gfufoldです。(予測はESMFoldに準じています)

アミノ酸配列を入力して「START」ボタンを押すだけで、 タンパク質立体構造をWebGLによってぐりぐりさわりながら確認できます。

予測結果は、PDB, CIFのファイル形式で、 また入力の配列データもテキスト(.txt)で保存することができます。

お問い合わせ等は下記メールアドレスまでよろしくお願いいたします。

uuktuv@gmail.com

※ テスト時のアミノ酸配列として、PETaseのアミノ酸配列を入力してみてください。

MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMRGPNPTAASLEASAGPFTVRSFTVSRPSGYGAGTVYYPTNAGGTVGAIAIVPGYTARQSSIKWWGPRLASHGFVVITIDTNSTLDQPSSRSSQQMAALRQVASLNGTSSSPIYGKVDTARMGVMGWSMGGGGSLISAANNPSLKAAAPQAPWDSSTNFSSVTVPTLIFACENDSIAPVNSSALPIYDSMSRNAKQFLEINGGSHSCANSGNSNQALIGKKGVAWMKRFMDNDTRYSTFACENPNSTRVSDFRTANCSLEDPAANKARKEAELAAATAEQ

gfufold.azurewebsites.net